2007年
10月 清华大学向北京市政府上报征地申请报告（清校文〔2007〕69号文《关于国家重点大项目建设用地有关事宜的请示》）
11月20日，北京市委书记刘淇率领市委、市政府及有关部门负责人和昌平区委区政府负责人一行考察调研200#现场，在听取清华大学关于《申请新征昌平清华核研院周边土地承担国家重大项目》的汇报后指示，总体上支持该规划，要求实实在在加快园区建设。
2008年
1月29日，取得北京市政府对外联络办《关于清华大学国家重大建设项目用地有关事宜的函》
3月21日，教育部以教发函〔2008〕81号~88号批复同意清华大学在昌平区南口镇征地建设尖端（国防）科学技术平台、国家公共安全平台及研究基地等八个科研基地项目
2009年
1月12日，北京市规划委员会下达《规划意见书（选址）》（2009规意选字0013号）
11月4日，清华大学与昌平区南口镇人民政府签订《清华大学项目征地委托协议》
2010年
2月7日，与南口镇虎峪村民委员会正式签订《征地补偿安置协议书》
2012年
5月29日，取得北京市规划委员会《建设用地规划许可证》（2012规地字0023号）
9月6日，取得北京市规划委员会《关于清华大学征地建设国家重大项目二期工程规划研究意见的函》（市规复【2012】1453号）
2013年
8月23日，取得北京市国土资源局《国有土地划拨决定书》（京国土划字【2013】10号）
2014年
9月12日，取得一期征地范围的《国有土地使用证》（京央昌国有2014划第00001~00003号）
2015年
12月1日，昌平科研基地建设领导小组召开会议，会议明确昌平建设办工作进入常态化，要求尽快推动科研基地各项建设工作。
